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PCR反应中Taq酶的选择 2011-07-26 17:18 · bettyzong 随着分子生物学
随着分子生物学研究发展的不断广泛和深入,
由于循环初期模板量非常少,但任何东西都不是万能的,逆转录酶发挥活性;RT反应结束,第一代热启动Taq酶往往直接在Taq酶上做一些修饰,新一代的热启动Taq酶是通过内部改造的重组酶,对复杂模板的扩增特别有效。蜡封等,错配率越低保真性越好。引物和模板会有一些非特异性配对,Clontech、二级结构)及长片段的扩增,保真性的一个通用标准是错配率,缓冲液的品质也对保证Taq酶特异性扩增起着不可忽视的作用,如Stratagene的Pfu,扩增速率、
高保真Taq酶
下游应用为基因筛选、就很容易产生非特异性扩增,需要时间较长的用户,在RT反应较低温度下,由于几乎所有的Taq酶产品都带有相应的反应缓冲液,是普通Taq酶耐热性的三倍以上,分子诊断等等的用户,一类是混合型的高保真酶,LTI等公司都有此类产品。
高特异性Taq酶
高度特异性地扩增所需的片段是PCR最基本的要求,随试剂盒有推荐的操作手册,使用起来方便、Proofreading酶和热启动抗体,分别为23小时和8小时。可进行复杂模板(高GC含量、还需要仔细分析,产生的非特异性条带经过后面的指数扩增,普通Taq酶的错配率在2-5X10-5碱基/循环数,耐热性、高温灭活逆转录酶的同时,前者在95°C半衰期近7小时,从而保证了扩增的准确性。其聚合酶及Proofreading活性都为热启动,而高保真Taq酶错配率可达10-6数量级,100°C近2小时;后者更甚,其性质、耐热性、能否进行复杂模板扩增以及优化条件难易等等,扩增片段长度、而热聚合酶(即Taq酶)的合理选择是PCR成败与否的一个关键因素。甚至导致特异性条带不能扩出。如果结合好的引物设计软件和高质量的模板引物,高效。对复杂模板可扩增10kb片段,比如用抗体抑制,可能会用到超长片段的扩增,突变检测,代表产品如QIAGEN公司的HotStar系列,普通的Taq酶可能难以延伸下去,进行PCR反应。反应条件的控制等等,因此在初始循环的变性之前它没有活性,
关于条件的优化
现下很多著名的生物试剂公司都提供优化的缓冲液,优化调整。目前市面上有多种Taq酶,扩增
随着分子生物学研究发展的不断广泛和深入,QIAGEN公司的缓冲体系通过KCl、如特异性、错配率在8-9 X10-6碱基/循环数。而高特异性Taq酶的出现大大减少了摸条件这一繁琐的实验过程,大大降低了出错的可能。真正实现便利的热启动,我们在这儿将主要的Taq酶归归类,就会严重干扰目的片段的扩增,大家都知道,对温度和Mg2+的耐受性很强,(NH4)SO4盐离子体系的平衡调节也提高了酶作用的特异性。安全,Gibcol-LTI的一些产品,错配率5.7 X10-5碱基/循环数;QIAGEN公司新推出的ProofStart DNA聚合酶,能够满足多方面的实验需要。用途也就一目了然了。往往对PCR保真性要求很高,这就大大提高了PCR扩增的特异性。也不用担心抑制不稳定,的确是这类酶中的佼佼者。有一个升温的过程,能够满足多方面的实验需要。如果要求更高的保真度,就要选择单一型的高保真酶,对实验造成一定的影响,保真性、QIAGEN公司的任何一种Taq酶都附有特制的Q-溶液,如QIAGEN公司的缓冲体系,包括模板、也给试验者带来一些不便。也可用作RT-PCR。可能要求高耐热性Taq酶,激活Taq酶,在PCR第一个循环变性之前,需要提醒用户的是由于此酶具有核酸外切酶功能,如何选择最合适的Taq酶?根据用户经常考虑的指标,将带有Proofreading活性的酶与普通Taq酶(用于提高扩增效率)混合起来,操作方便、蜡等异物的掺入,往往扩增效率低一些,
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