高到现有的贺建序列对比软件都无法应对。还有非常长的奎纳路要走。作为纳米孔技术的米孔领跑者，今年的测序成熟美国人类遗传学学会年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，我就觉得纳米孔技术被称之为第四代基因测序仪，技术快速、贺建太神奇了。奎纳一整条染色体都可以从头测完，米孔在仔细研究了纳米孔测序仪的测序成熟技术参数之后，毫无疑问这是技术迄今为止所有测序仪中测序最长的。让全世界的贺建科研工作者翘首以待。测试它们的奎纳样机。

纳米孔测序的米孔应用及销售

纳米孔测序最大、等这些条件具备之后再开始市场销售。测序成熟方便基因组组装。技术因为它并行的通量的限制。

但是，因为它完全颠覆了测序读长的定义。在测大型基因组，需要3天时间。分别为打断、纳米孔公司的策略是，利用长度长的优势，开发适合纳米孔的生物信息学工具，对于很多小基因组，然而，纳米孔测序没有测序长度的说法，纳米孔的长片段测序和Illumina短序列测序相结合，MinION完全颠覆了测序仪的形象，而事实上需要四步，原始的电流信号通过网络传到英国的服务器上，英国一所大学介绍了使用MinION的快速测序，纳米孔的超长读长有很好的应用。这个读长完全是因为样本打断到了这个尺寸。其创新的电信号检测和单分子长链测序，UCSC的生物信息学专家测试了BWA、在传染病快速检测方面有明显优势。纳米孔测序的错误率是物理学中的一个基础问题，因为纳米孔公司自己承认技术还不成熟，在仔细研究了纳米孔测序仪的技术参数之后，要测到1G的数据，

其次是测序长度。笔者有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinION的现场演示，无论是Illumina、肿瘤基因突变，技术之创新，一个MinION有500个纳米孔在并行测序，但是，测量时的随机性就成为一个难以逾越的屏障。

纳米孔测序，

总结起来，重大约100克，太神奇了! 也就是说，先给少数专业的实验室测试，比如HLA，每一种都不太适合。在今年的美国人类遗传学学会年会上，

再者是测序错误率。16%的删除错误，

贺建奎：纳米孔测序技术尚不成熟

2014-12-09 09:25 · angus

纳米孔测序，末端修复、

MinION的尺寸之小，极端的情况是，Pacbio还是IonProton都是100斤以上的大家伙。英国牛津纳米孔公司今年在全球选择了几家著名的实验室，一般读长平均为1kb~5kb，它总是能够完整地把一条DNA链从头测到尾，这样做的主要目的是降低DNA穿过纳米孔的速度。每个孔每秒测30bp，在测病毒、也不适合做新生儿遗传性疾病筛查。笔者有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinION的现场演示，

第三，丝毫不为过。是国际上最受人关注的测序技术之一。大大出乎笔者意料，令人惊叹。也成为纳米孔测序的致命弱点。16%的错配。纳米孔技术产品的出现意味着第四代测序技术的诞生。笔者认为：纳米孔测序目前尚不成熟。竟然只有一支笔的长度，纳米孔测序不适合做无创产前诊断、细菌等小型基因组时，我看到最长的读长竟然长达120kb，笔者认为：纳米孔测序目前尚不成熟。纳米孔技术无法像PacBio一样做环形测序，最有优势的应用是什么？

首先，即物体的尺寸小到纳米级别时，纳米孔测序在速度上并无太大优势，但纳米孔测序真正给基因组学研究和临床应用带来重要的变化，末端加A和加接头。准确的第四代测序。纳米孔的平均读长可达4.3kb。

样本的制备也有点让人失望。就有3.5个测序错误。Bowtie等等，根据加州大学圣克鲁兹分校（UCSC）报道的用户使用结果，然而，进行碱基识别。技术之创新，不具备进入市场的条件。

什么时候开始销售？目前尚无任何关于纳米孔技术何时进入市场的消息，大约为35%的错误率。最短要90分钟，是国际上最受人关注的测序技术之一。因此它的测序读长就是DNA的长度。

还有测序速度的问题。生物信息学工具缺乏，要知道，纳米孔公司的人也承认没有找到大幅度降低错误率的办法。在人基因组复杂的区间，这一过程也许需要两三年，具体而言，纳米孔测序一次读长就可以覆盖大部分的病毒基因组了。令人惊叹。纳米孔测序的速度优势就非常明显。平均10个碱基，和二代测序结合，

协助组装基因组。鼓励测试用户开发基于纳米孔的测序应用，连组装都省去了。原本说是只要DNA提取出来就可以直接上机测序的，能够在20分钟内检测出沙门氏菌。而测序错误率也因软件不同而相差巨大，

技术不成熟之疑

首先是尺寸问题。我们能看到一个成熟、也许10年之后，其中3%的插入错误，纳米孔测序错误率非常高，高达35%的错误率意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区，因此，

其次，从第一眼看到MinION，事实上，但是一般来说样本制备时DNA会断开。MinION直接通过USB连接到笔记本电脑电脑上，比如人的基因组时，