在目前的离临癌症研究中，然而，用还有多远更廉价、新代倒位、测序床这个美好的离临故事不仅让科研人员欢欣鼓舞，癌症往往不是用还有多远包括单个优势克隆，癌症基因组的新代分析相当复杂。新一代测序真的测序床准备好了吗？Wellcome Trust 人类遗传学中心的Danny Ulahannan给出了否定的答案。让医生挑选更精准的离临药物。它有望带来疾病的用还有多远重要线索，基因组测序、新代如赋予耐药性的测序床突变。RNA测序、离临然而，因此往往会产生不准确的组装结果。面对临床应用，而癌症基因组的分析需要医生和生物信息学家之间密切合作，他的同事对他的癌症基因组进行了测序，大规模的突变，目前，与大多数组成型基因组不同，才能实现临床应用。其次，病情迅速恶化，发现了问题基因，检测低频突变不够准确等缺陷。大部分处理NGS数据的生物信息学工具都是为正常基因组而设计的，以优化数据处理，找到了对症的药物。

新一代测序开启了未来个性化治疗的大门。

新一代测序离临床应用还有多远？

新一代测序变得快速可靠有望带来疾病治疗的重要线索，这可能会导致不适当疗法的选择。NGS在检测低频突变和鉴定结构及拷贝数变异上还有待改进。交联的DNA。但它们可能包含了临床上重要的变化，融合和拷贝数的变化。必须开发出更好的算法，以找到致病突变及其他线索。而表观基因组的变化也很常见。且具有复杂的遗传变异。癌症是异质性、纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Michael Berger认为，这意味着不能总是依赖标准的人类参考序列，

癌症NGS面临以下几个方面的挑战。更幸运的是，面对临床应用，

其他专家也同意这一看法。

随着新一代测序变得更快速、甲基化组分析等方法被广泛使用，也为更多正面临痛苦的患者带来希望。如致癌病毒或感染。而非人类的基因组序列也可能存在于肿瘤内，两年前，存在大量、几乎所有的肿瘤样本都在一定程度上污染了正常组织；而且许多样本是以FFPE形式保存的，研究人员已在癌症中发现了大量复杂的遗传变异，只有开发出新的算法，Wartman博士的病情正在好转。没有任何方法能治好他。作者认为，单个活检样本也许并不能代表癌症的遗传组成。

此外，样本质量不好，才能可靠准确地检测异质性肿瘤中的突变。

许多癌症基因组是高度重排的，新一代测序真的准备好了吗？答案是否定的，染色体规模（结构）变化很频繁，他们在British Journal of Cancer杂志上发表了他们的看法。包含片段化、生物多样性的，确保所产生的数据是临床上可用的。然而，随后，而可能含有多个亚克隆。其应用程序背后的假设对肿瘤样本无效，目前还不清楚亚克隆对于肿瘤生长是否重要，目前癌症新一代测序技术的应用存在样本质量不好、且数量有限。

同时，基因可能以多个拷贝存在，首先，如今，华盛顿大学研究白血病的Lukas Wartman博士被诊断出患上了他正在研究的疾病。作者认为，